Denitraatti on taloudellinen, luonnollinen ja huokoinen materiaali, jonka huokosjakauma ja geometria edistävät sekä aerobista nitrifikaatiota ensimmäisillä millimetreillä syvyydessä että anaerobista denitrifikaatiota keskellä. Materiaalilla on suuri pinta-ala ja se tukee korkeaa bakteeritiheyttä. Vaikka denitraatilla on kyky sitoa nitraatteja, tämä kyky, kuten muillakin nitraattia pidättävillä materiaaleilla, kuten joillakin zeoliiteilla ja synteettisillä hartseilla, on melko rajallinen, ja ensisijainen mekanismi nitraatin poistoon on anaerobinen denitrifikaatio.

"Elävä" kivi eli riuttakivi poistaa nitraatteja anaerobisen denitrifikaation kautta. Denitraatti poistaa nitraatteja samalla prosessilla. Tehokkuus kasvaa moninkertaisesti johtamalla vettä huokoisen denitraatin läpi. Kuten riuttakiven kohdalla, anaerobiset olosuhteet saavutetaan huokoisuuden ja hapenpuutteen kautta aerobisten prosessien kautta pinnalla. Siksi liiallisia virtausnopeuksia tulisi välttää, koska ne voivat estää riittävän anaerobisen ympäristön syntymisen denitrifioivien bakteerien kehittymiselle. Denitraatti on myös erinomainen aerobinen nitrifioija ja sopii erinomaisesti biologiseksi suodattimeksi tippa-altaissa, kanisterisuodattimissa, laskeutussäiliöissä tai jopa laatikkosuodattimissa. Suurilla virtausnopeuksilla (yli 100 US gallonaa tunnissa) se toimii yksinomaan aerobisena suodattimena. Pienillä virtausnopeuksilla (alle 50 US gallonaa tunnissa) se toimii sekä aerobisena suodattimena että anaerobisena denitrifioivana suodattimena.